普哈丁墓园，是一座典型的阿拉伯式建筑，初建于公元十三世纪的我国南宋时期，明永乐皇帝视墓园为国宝，下诏予以保护。清政府也对墓亭进行了多次修建，亭壁上还嵌有光绪三十四年重修墓园时建立的"先贤历史记略碑"，碑文用汉字刻定，简要记叙了普哈丁在我国传教的情况。

墓园坐东朝西，墓亭为阿拉伯制式。正门临河，门额刻石为"西域先贤普哈丁之墓"下署"乾隆丙辰重建"。门厅3楹南侧，为清真寺，面东南楹。沿石阶抵"天方矩矱"墓域门厅，厅3楹为四角攒尖顶。庭院中，有北轩、东轩各3楹。北轩附近建南北相对墓亭两座。亭后即普哈丁墓亭。亭平面呈方形，四壁设拱门，四角攒尖板瓦顶，内层呈拱球顶。墓葬于亭中央地下，地面用青石砌成五级矩形墓塔。墓亭东北植有700多年树龄的银杏1株，老干虬枝，姿态奇特。

整个墓园建筑分三部分。第一部分为墓域，内有普哈丁墓及其他阿拉伯人的墓碑；第二部分为清真寺，是教徒们做礼拜的活动场所；第三部分为东郊公园。此外墓园里还集中保存了一些我国元代遗留下来的阿拉伯文墓碑。