清真南大寺位于市中区西青龙街礼拜寺巷内，占地5238平方米，建筑面积2380．9平方米。据寺内存1495年（明弘治八年）《济南府礼拜寺重修碑文记》载：该寺始建于1295年（元元贞元年），经明、清、民国时期几次重修扩建，设备完整，包括影壁、大门楼、礼拜殿、宣喻台、邦克楼、望月楼、南北讲堂、俗室等。主殿由后殿、前殿和卷棚组成。寺内有历代碑文、匾额。该寺历史悠久，规模宏伟，建筑风格符合伊斯兰教规并属中国古典庙宇式建筑群体，为山东清真寺之冠，济南穆斯林主要的礼拜斋戒庆典之地。

1966－1967年“文化大革命”期间曾遭一定程度破坏，经修整后为省级重点文物保护单位，也是省暨济南市民族宗教文化对外交往和交流的重要窗口。与本寺毗邻的还有清真北大寺和清真女寺。