奇台荒漠草原保护区位于新疆昌吉回族自治州奇台县境内东北部，离奇台县城的直线距离仅40千米，位于东经89o53`~90o08`，北纬44o12`~44o26`。保护区在1986年由自治区人民政府批准建立，总面积38419公顷，主要保护对象为荒漠草原及其生态系统。

保护区中的动物种类：沙鸡、鹅喉羚、大耳猥、沙鼠、跳鼠、沙蜥、沙虎、东方沙蟒、戴胜、云雀、三趾鹬、蓝点颏、蒙古野马、野双峰驼、蒙古野驴、高鼻羚羊等。

保护区中的植物种类：小乔木白梭梭、灌木沙拐枣、半灌木陀绒藜、沙漠绢蒿、丛生禾小乔木白梭梭、灌木沙拐枣、半灌木驼绒藜、沙漠绢蒿、丛生禾草羽状三芒草白茎绢蒿、猪毛莱、木地肤、刺木蓼、角果藜、蛇麻黄等。