1850年亚马逊升级为州后，即获准在亚马孙河及其支流使用蒸汽船航行。50年后，该地区因开采橡胶，经济市场一片欣欣向荣，修复旧玛瑙斯港便成为当时非常重要的一件工程。修复工程历时五年左右，港口在1907年正式启用。玛瑙斯港建在黑河畔，有一座浮动式码头，可以随着水位上升或下降。港口也可以停泊大型船只。自启用后迄今，玛瑙斯港即成为巴西国内重要的观光客和货物流通站。

整个玛瑙斯港建筑体都在1987年被列为国家级古迹，包括圣维仙琪岛大楼（Rua Bernardo Ramos）、中央办公室（Rua Taqueirinha）、州议会附设大楼（Rua Governador Vitorio）和旧公库大楼（Rua Maurício de Souza）。前述三栋大楼都是在港口进行修复前建成的楼宇。除了玛瑙斯港的百年建筑，游客还可以参观港口博物馆，展出许多珍贵的文史数据和照片。